История создания Центра берёт своё начало в июне 1989 года, когда решением исполнительного комитета Советского районного совета народных депутатов № 1620 от 14 июня 1989 года был создан районный Центр профессиональной психодиагностики детей и подростков. Совместно с Научно-Исследовательским Институтом Нейрокибернетики при Ростовском Государственном Университете специально были разработаны методы и программно-технические средства профессиональной диагностики школьников, договор № 2974 от 12 июня 1989 года.

Центр успешно решал задачу исследования и оценки индивидуально-типологических особенностей школьников, что позволяло ориентировать их на выбор профессии в соответствии со способностями, рационально распределять по специальностям, решать практические задачи и разрабатывать рекомендации для адекватной профориентации.

Учитывая актуальность деятельности Центра и реальную помощь образовательным учреждениям, 14 сентября 1993 года приказом Городского управления образования № 294 было принято решение о создании муниципального психолого-педагогического диагностического центра Советского района. Центр действовал на основании Положения.

В 2001 году Центр получил новый статус и название «Муниципальное образовательное учреждение для детей, нуждающихся в психолого-педагогической и медико-социальной помощи: Центр диагностики и консультирования Советского района города Ростова-на-Дону». В 2002 году была подготовлена первая редакция Устава Центра.